MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw2 genomic sequence

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020264	ATG	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338575
2	NC_020264	TA	3	6	134	139	50 %	50 %	0 %	0 %	449338575
3	NC_020264	TCTT	2	8	203	210	0 %	75 %	0 %	25 %	449338575
4	NC_020264	GTTTAA	2	12	278	289	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449338575
5	NC_020264	ATGT	2	8	437	444	25 %	50 %	25 %	0 %	449338575
6	NC_020264	TCA	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338575
7	NC_020264	TAA	2	6	523	528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338575
8	NC_020264	T	6	6	531	536	0 %	100 %	0 %	0 %	449338575
9	NC_020264	TTC	2	6	544	549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338575
10	NC_020264	ATG	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338575
11	NC_020264	AT	3	6	641	646	50 %	50 %	0 %	0 %	449338575
12	NC_020264	TAG	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338575
13	NC_020264	ATT	2	6	1058	1063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338576
14	NC_020264	TCT	3	9	1066	1074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338576
15	NC_020264	CAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338576
16	NC_020264	AGT	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338576
17	NC_020264	TA	3	6	1571	1576	50 %	50 %	0 %	0 %	449338577
18	NC_020264	T	6	6	1631	1636	0 %	100 %	0 %	0 %	449338577
19	NC_020264	A	6	6	1661	1666	100 %	0 %	0 %	0 %	449338577
20	NC_020264	TGA	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338577
21	NC_020264	ATG	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338577
22	NC_020264	CAAT	2	8	2060	2067	50 %	25 %	0 %	25 %	449338578
23	NC_020264	T	6	6	2136	2141	0 %	100 %	0 %	0 %	449338578
24	NC_020264	TTC	2	6	2152	2157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338578
25	NC_020264	T	6	6	2172	2177	0 %	100 %	0 %	0 %	449338578
26	NC_020264	CTA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
27	NC_020264	AT	3	6	2186	2191	50 %	50 %	0 %	0 %	449338578
28	NC_020264	TAT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338578
29	NC_020264	AT	3	6	2236	2241	50 %	50 %	0 %	0 %	449338578
30	NC_020264	T	6	6	2291	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	449338578
31	NC_020264	TAA	2	6	2346	2351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338578
32	NC_020264	TTA	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338578
33	NC_020264	CT	3	6	2413	2418	0 %	50 %	0 %	50 %	449338578
34	NC_020264	ATTT	2	8	2425	2432	25 %	75 %	0 %	0 %	449338578
35	NC_020264	CGT	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338578
36	NC_020264	TCT	2	6	2516	2521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338578
37	NC_020264	ATT	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338578
38	NC_020264	T	6	6	2605	2610	0 %	100 %	0 %	0 %	449338578
39	NC_020264	T	7	7	2688	2694	0 %	100 %	0 %	0 %	449338578
40	NC_020264	CAT	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
41	NC_020264	CTA	2	6	2723	2728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
42	NC_020264	TCA	2	6	2771	2776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
43	NC_020264	A	6	6	2830	2835	100 %	0 %	0 %	0 %	449338578
44	NC_020264	AATT	2	8	2838	2845	50 %	50 %	0 %	0 %	449338578
45	NC_020264	TA	3	6	2892	2897	50 %	50 %	0 %	0 %	449338578
46	NC_020264	TAA	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338579
47	NC_020264	TAT	2	6	3815	3820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338579
48	NC_020264	AT	3	6	3848	3853	50 %	50 %	0 %	0 %	449338579
49	NC_020264	TG	3	6	3898	3903	0 %	50 %	50 %	0 %	449338579
50	NC_020264	ATC	2	6	4253	4258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338580
51	NC_020264	TA	3	6	4327	4332	50 %	50 %	0 %	0 %	449338580
52	NC_020264	TGT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338580
53	NC_020264	TATCC	2	10	4424	4433	20 %	40 %	0 %	40 %	449338580
54	NC_020264	CTTCAA	2	12	4436	4447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338580
55	NC_020264	T	6	6	4616	4621	0 %	100 %	0 %	0 %	449338581
56	NC_020264	ATA	2	6	4629	4634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338581
57	NC_020264	AT	3	6	6418	6423	50 %	50 %	0 %	0 %	449338582
58	NC_020264	TTC	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338582
59	NC_020264	ATC	2	6	6473	6478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338582
60	NC_020264	AT	3	6	6485	6490	50 %	50 %	0 %	0 %	449338582
61	NC_020264	T	7	7	6565	6571	0 %	100 %	0 %	0 %	449338582
62	NC_020264	ATA	2	6	6743	6748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
63	NC_020264	ACA	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338583
64	NC_020264	ATC	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338583
65	NC_020264	A	7	7	6894	6900	100 %	0 %	0 %	0 %	449338583
66	NC_020264	A	6	6	6921	6926	100 %	0 %	0 %	0 %	449338583
67	NC_020264	GAA	2	6	6944	6949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
68	NC_020264	TAA	2	6	6970	6975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
69	NC_020264	TA	3	6	7059	7064	50 %	50 %	0 %	0 %	449338583
70	NC_020264	GAT	2	6	7073	7078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338583
71	NC_020264	GAA	2	6	7085	7090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
72	NC_020264	TAT	3	9	7114	7122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338583
73	NC_020264	CAA	2	6	7149	7154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338583
74	NC_020264	TAA	2	6	7192	7197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
75	NC_020264	TGA	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338583
76	NC_020264	TAA	2	6	7246	7251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
77	NC_020264	AAG	2	6	7256	7261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
78	NC_020264	T	7	7	7308	7314	0 %	100 %	0 %	0 %	449338583
79	NC_020264	ATA	2	6	7335	7340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
80	NC_020264	ATC	2	6	7345	7350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338583
81	NC_020264	A	7	7	7361	7367	100 %	0 %	0 %	0 %	449338583
82	NC_020264	AAG	2	6	7380	7385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
83	NC_020264	TA	3	6	7388	7393	50 %	50 %	0 %	0 %	449338583
84	NC_020264	AATT	2	8	7413	7420	50 %	50 %	0 %	0 %	449338583
85	NC_020264	A	7	7	7437	7443	100 %	0 %	0 %	0 %	449338583
86	NC_020264	A	6	6	7488	7493	100 %	0 %	0 %	0 %	449338583
87	NC_020264	T	7	7	7495	7501	0 %	100 %	0 %	0 %	449338583
88	NC_020264	TAA	2	6	7678	7683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338584
89	NC_020264	A	7	7	7682	7688	100 %	0 %	0 %	0 %	449338584
90	NC_020264	AAGAA	2	10	7704	7713	80 %	0 %	20 %	0 %	449338584
91	NC_020264	CAT	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338584
92	NC_020264	A	7	7	7760	7766	100 %	0 %	0 %	0 %	449338584
93	NC_020264	AAAGA	2	10	7790	7799	80 %	0 %	20 %	0 %	449338584
94	NC_020264	A	7	7	7799	7805	100 %	0 %	0 %	0 %	449338584
95	NC_020264	A	7	7	7837	7843	100 %	0 %	0 %	0 %	449338584
96	NC_020264	AGTT	2	8	7851	7858	25 %	50 %	25 %	0 %	449338584
97	NC_020264	GAA	2	6	7859	7864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338584
98	NC_020264	AAT	2	6	7865	7870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338584
99	NC_020264	TCA	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338584

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.